更新時間:2022-06-12
illumina二代測(ce)序(xu)儀MiSeq系統可通(tong)過各種(zhong)測(ce)序(xu)應用(yong)為(wei)您的研究提(ti)供(gong)便利。它能夠自動生成雙端read,每次(ci)運(yun)行的產出高達15 Gb,每條read可提(ti)供(gong)600多個(ge)堿基的測(ce)序(xu)數(shu)據。它使用(yong)的文庫制備試劑盒已(yi)針對多種(zhong)應用(yong)進(jin)行了優化,包括(kuo)靶向基因測(ce)序(xu)、小型基因組測(ce)序(xu)、擴(kuo)增子測(ce)序(xu)、16S宏基因組學等。
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Illumina公司推出的(de)MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新款測序儀,每次運行能產生超過1Gb的數據,且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準確性,讓它成為快速且經濟的遺傳分析的理想平臺,適合廣泛的應用。同時Illumina已被FDA大量采購并即將通過FDA認證,12年10月,MiSeq系統的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩個方面完成,一個是cluster密度的增大,升級后cluster密度增加至15-17million,而pair-end讀取的reads數目將會增加至30-34million;另一方面是通過測序讀長而提升通量,測序讀長達到2*300bp,同時測序速度也有所提升。目前,Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長,Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質量數據結果的前提下完成的。
Illumina MiSeq測(ce)序時間和數(shu)據量
讀(du)長(bp) | 時(shi)間 | 總數據量(liang) | Q30 |
1×36 | ~4 hrs | 540-610 Mb | ﹥90% |
2×25 | ~5.5 hrs | 750-850 Mb | ﹥90% |
2×100 | ~16.5 hrs | 3.0-3.4 Gb | ﹥85% |
2×150 | ~24 hrs | 4.5-5.1 Gb | ﹥80% |
2×250 | ~39 hrs | 7.5-8.5 Gb | ﹥70% |
Illumina MiSeq讀取(qu)量比對
運行類型 | 通過過濾(lv)的讀取(百萬) | |
升(sheng)級前 | 升級(ji)后 | |
單(dan)端讀取 | 5-7 M | 15-17 M |
末端配對讀取(qu) | 10-14 M | 30-34 M |
illumina二代測序儀 MiSeq四大特性
1、較短的實驗周(zhou)期:從(cong)樣品制備(bei)開始需要8小時即可得到超(chao)過100M的高質量測序結果(guo)。
2、便捷的樣品(pin)制備流(liu)程:需50ngDNA模板,2小時的自動化操(cao)作就可(ke)以(yi)完(wan)成全部樣品(pin)制備工作。
3、測序原理:MiSeq繼續GA和(he)HiSeq平臺的邊合成(cheng)邊測序的化學原理。
4、完整的整合功能:MiSeq可(ke)以獨(du)立完成(cheng)簇生成(cheng),雙向測序及(ji)數(shu)據(ju)分析工作,讓經費和實驗室空(kong)間不再成(cheng)為NGS研究的障礙。
illumina二代測序儀 MiSeq應用范圍
1、轉錄組測(ce)序
派森諾MiSeq測(ce)(ce)序(xu)平臺是(shi)基因組(zu)已(yi)測(ce)(ce)序(xu)物(wu)種的(de)轉錄(lu)組(zu)分(fen)析(xi)平臺。公司(si)技(ji)術團隊目前已(yi)完成(cheng)了包括斑(ban)馬(ma)魚在內(nei)的(de)多種植物(wu)、動物(wu)的(de)轉錄(lu)組(zu)測(ce)(ce)序(xu)及分(fen)析(xi)。
2、宏(hong)基(ji)因(yin)組16S rDNA單(dan)V區測序(xu)
對16s rDNA的(de)單(dan)V區(qu)(V3\V4)進(jin)行高(gao)通量(liang)測序,鑒(jian)定細(xi)菌群和古生(sheng)菌群。派森諾的(de)技術團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qu)并結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qu)成(cheng)功的(de)對雞(ji)的(de)腸道環境細(xi)菌進(jin)行了鑒(jian)定。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀(du)長配(pei)合了小(xiao)RNA的測序(xu)長度(du),速(su)度(du)快(kuai),靈敏度(du)高(gao)。派森諾的技術團隊目(mu)前已完成了鵝的小(xiao)RNA測序(xu)和(he)多種中(zhong)草藥的小(xiao)RNA測序(xu)。
4、重測(ce)序:包括全基因(yin)組重測(ce)序、簡化(hua)基因(yin)組測(ce)序、外(wai)顯子測(ce)序。
Illumina MiSeq非常(chang)適(shi)用于對(dui)微(wei)生(sheng)(sheng)物基(ji)因(yin)組(zu)的重(zhong)測(ce)序(xu),每次運行(xing)即(ji)可完成(cheng)一個微(wei)生(sheng)(sheng)物基(ji)因(yin)組(zu)測(ce)序(xu)。2011年(nian)12月27日,派(pai)森諾的技術團隊利(li)用MiSeq一次運行(xing)同時(shi)完成(cheng)了乳酸(suan)菌(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重(zhong)測(ce)序(xu),基(ji)因(yin)組(zu)覆(fu)蓋(gai)深度為分別為404倍和213倍,比對(dui)至參(can)考序(xu)列,基(ji)因(yin)組(zu)實(shi)現全覆(fu)蓋(gai),同時(shi)檢(jian)測(ce)到了多種(zhong)結構變(bian)異,包括插入(ru)、缺失和SNP位點(dian),并且檢(jian)測(ce)到了全部質粒。
* 以上產品介紹(shao)及數據來(lai)源于Illumina,僅(jin)供參考,以Illumina為準。